目前适用的《罪犯保外就医执行办法》是司法部、最高人民检察院、公安部于1990年12月31日颁布的。该办法第八条规定，保外就医的审批机关为省、自治区、直辖市劳改局。刑诉法第二百一十四条并未明确规定审批机关。该法条没有明确规定审批机关，主要是因为法制还不健全，需要有个实践过程，所以既可由法院裁定暂予监外执行，也可由罪犯监管单位的上级机关（劳改局或公安局）批准保外就医。但笔者认为，罪犯保外就医由劳改局（监狱管理局）批准符合经济效率原则：（1）时间长，上呈下达一般需要一个月；（2）浪费人力物力，有疑问或手续不全的得不到及时纠错；（3）有严重疾病的罪犯得不到及时有效的治疗。
笔者认为，暂予监外执行与减刑、假释有相近之处，保外就医也应由法院裁定。理由是：首先，法律赋予法院暂予监外执行的裁定权，而没有赋予其他执法机关裁定权，其他机关只是拥有执行刑罚中的监管监督权；其次，法院对保外就医以外的情形可以裁定暂予监外执行（如对正在怀孕或哺乳自己婴儿的妇女，在怀孕期或哺乳期由法院裁定），那么保外就医也应由法院裁定；再次，由法院裁定，使监管、审批分离，达到相互制约、相互监督，促进执法统一性、公正性；最后，有利于患严重疾病的罪犯得到及时治疗，符合经济、方便、效率的原则。
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魏兆辉 杨有荣